ABSTRACT
Introduction: La France dispose d'une des bases de donnees medico-administratives les plus completes et homogenes au monde: le Systeme national des donnees de sante (SNDS). Cette base de donnees, initialement destinee a la gestion financiere de l'Assurance maladie, a longtemps ete sous-exploitee pour la recherche en sante en raison de sa complexite. Pour faciliter sa reutilisation, une piste de travail est sa standardisation via l'utilisation de modeles de donnees communs. Methodes: Depuis 2020, le Health Data Hub (HDH) transforme le SNDS vers le modele OMOP-CDM (<< Observational Medical Outcomes Partnership - Common Data Model >>). Cette transformation permet de creer un modele relationnel centre sur une table "patient" et de facilement reconstruire les parcours de soins. A partir d'un extrait du SNDS couvrant la periode 2019-2020 pour une population hospitalisee pour COVID (SNDS Fast-Track), un alignement des schemas de donnees et des terminologies ont ete realises. Les scripts de transformation sont developpes en Python et les validations sont effectuees via les logiciels du consortium OHDSI. Des travaux d'harmonisation ont ete realises avec des partenaires institutionnels (AP-HP, BPE). Resultats: Ce travail a permis de passer d'une base de donnees de plus de 180 tables a moins de 20 tables. Les alignements de terminologies ont ete realises par des internes en medecine sur plusieurs milliers de codes de differentes nomenclatures (CCAM, NABM, CSARR, etc.) vers SNOMED-CT. L'ensemble est disponible via la documentation collaborative du SNDS. Des travaux sont menes pour elargir le perimetre temporel (2015-2021). Discussion/Conclusion: La standardisation des bases de donnees de sante assure leur normalisation et interoperabilite, rendant leur exploitation croisee au niveau national et international plus efficace. L'utilisation de modeles de donnees communs accelere le partage de donnees, de documentation et de programmes. Plusieurs initiatives europeennes sont actuellement en cours telles que l'action conjointe TEHDAS et le pilote EHDS2 mene par le HDH. Mots-cles: Interoperabilite;SNDS;OMOP-CDM;Open source;ETL Declaration de liens d'interets: Les auteurs declarent ne pas avoir de liens d'interets.Copyright © 2023